MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 5057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011982	TTC	2	6	77004	77009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_011982	CCG	2	6	77041	77046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_011982	GAC	2	6	77057	77062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_011982	TCC	2	6	77107	77112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_011982	GCC	2	6	77147	77152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_011982	GCG	2	6	77156	77161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_011982	TCA	2	6	77222	77227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_011982	GTC	2	6	77257	77262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_011982	ATG	2	6	77302	77307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_011982	GCTG	2	8	77335	77342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_011982	CTT	2	6	77387	77392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_011982	AAG	2	6	77428	77433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011982	GCC	2	6	77441	77446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_011982	TTCGCT	2	12	77451	77462	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_011982	GGC	2	6	77523	77528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_011982	TCAG	2	8	77537	77544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_011982	CAG	2	6	77575	77580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_011982	AAG	2	6	77632	77637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_011982	GC	3	6	77656	77661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_011982	GCG	2	6	77666	77671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_011982	GGC	3	9	77745	77753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_011982	ATA	2	6	77792	77797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011982	GCC	2	6	77817	77822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_011982	GCG	2	6	77831	77836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_011982	TCG	2	6	77880	77885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080174
1526	NC_011982	AGG	2	6	77920	77925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080174
1527	NC_011982	TCG	2	6	77928	77933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080174
1528	NC_011982	TCC	2	6	77958	77963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080174
1529	NC_011982	GGC	2	6	77981	77986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080174
1530	NC_011982	TGG	2	6	78037	78042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080174
1531	NC_011982	GC	3	6	78065	78070	0 %	0 %	50 %	50 %	222080174
1532	NC_011982	GAAC	2	8	78131	78138	50 %	0 %	25 %	25 %	222080174
1533	NC_011982	TGG	2	6	78151	78156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080174
1534	NC_011982	CTGTG	2	10	78162	78171	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1535	NC_011982	TTG	3	9	78275	78283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011982	GAG	2	6	78287	78292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_011982	GCC	2	6	78297	78302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_011982	GAA	2	6	78308	78313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_011982	GTCG	2	8	78392	78399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_011982	GCA	2	6	78419	78424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_011982	CCAC	2	8	78425	78432	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1542	NC_011982	CTG	2	6	78473	78478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_011982	AGG	2	6	78530	78535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011982	GAA	2	6	78563	78568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080175
1545	NC_011982	CGG	2	6	78613	78618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080175
1546	NC_011982	CAT	2	6	78662	78667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080175
1547	NC_011982	GCT	2	6	78680	78685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1548	NC_011982	CGC	2	6	78728	78733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080175
1549	NC_011982	TGG	2	6	78868	78873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080175
1550	NC_011982	CCG	2	6	78876	78881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080175
1551	NC_011982	TGG	2	6	78901	78906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080175
1552	NC_011982	AGC	2	6	78931	78936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1553	NC_011982	ACG	2	6	78951	78956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1554	NC_011982	ACG	2	6	79021	79026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1555	NC_011982	GC	3	6	79055	79060	0 %	0 %	50 %	50 %	222080175
1556	NC_011982	TCGG	2	8	79095	79102	0 %	25 %	50 %	25 %	222080175
1557	NC_011982	GGC	2	6	79186	79191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080175
1558	NC_011982	CG	3	6	79229	79234	0 %	0 %	50 %	50 %	222080175
1559	NC_011982	ATC	2	6	79236	79241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080175
1560	NC_011982	CAT	2	6	79280	79285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080175
1561	NC_011982	CTG	2	6	79287	79292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1562	NC_011982	GCGA	2	8	79314	79321	25 %	0 %	50 %	25 %	222080175
1563	NC_011982	CGGCT	2	10	79329	79338	0 %	20 %	40 %	40 %	222080175
1564	NC_011982	GGC	2	6	79354	79359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080175
1565	NC_011982	GCA	2	6	79363	79368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1566	NC_011982	GAA	2	6	79395	79400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080175
1567	NC_011982	CTG	2	6	79401	79406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1568	NC_011982	GCT	2	6	79433	79438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1569	NC_011982	CGGC	2	8	79458	79465	0 %	0 %	50 %	50 %	222080175
1570	NC_011982	GC	3	6	79547	79552	0 %	0 %	50 %	50 %	222080175
1571	NC_011982	CGG	2	6	79562	79567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080175
1572	NC_011982	CGG	2	6	79609	79614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080175
1573	NC_011982	TGC	2	6	79663	79668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1574	NC_011982	CGA	2	6	79768	79773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1575	NC_011982	CGCT	2	8	79799	79806	0 %	25 %	25 %	50 %	222080176
1576	NC_011982	GCG	2	6	79910	79915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080176
1577	NC_011982	TCG	2	6	79922	79927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1578	NC_011982	GCG	2	6	79945	79950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080176
1579	NC_011982	CT	3	6	79965	79970	0 %	50 %	0 %	50 %	222080176
1580	NC_011982	CAT	2	6	80018	80023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080176
1581	NC_011982	TGC	2	6	80035	80040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1582	NC_011982	GC	3	6	80081	80086	0 %	0 %	50 %	50 %	222080176
1583	NC_011982	AGCCC	2	10	80121	80130	20 %	0 %	20 %	60 %	222080176
1584	NC_011982	GCT	2	6	80164	80169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1585	NC_011982	TGC	2	6	80238	80243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1586	NC_011982	CAA	2	6	80263	80268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080176
1587	NC_011982	CGG	2	6	80333	80338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080176
1588	NC_011982	GAC	2	6	80351	80356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1589	NC_011982	GTCGC	2	10	80455	80464	0 %	20 %	40 %	40 %	222080176
1590	NC_011982	GAT	2	6	80531	80536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080176
1591	NC_011982	TCG	2	6	80550	80555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1592	NC_011982	CGG	2	6	80640	80645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080176
1593	NC_011982	GA	3	6	80667	80672	50 %	0 %	50 %	0 %	222080176
1594	NC_011982	CGCTC	2	10	80688	80697	0 %	20 %	20 %	60 %	222080177
1595	NC_011982	GCA	2	6	80727	80732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080177
1596	NC_011982	GCT	2	6	80781	80786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080177
1597	NC_011982	CGC	2	6	80928	80933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080177
1598	NC_011982	CCGTG	2	10	81063	81072	0 %	20 %	40 %	40 %	222080177
1599	NC_011982	TGC	2	6	81122	81127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080177
1600	NC_011982	GAAA	2	8	81258	81265	75 %	0 %	25 %	0 %	222080177
1601	NC_011982	GCC	2	6	81394	81399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080177
1602	NC_011982	CGGC	2	8	81423	81430	0 %	0 %	50 %	50 %	222080177
1603	NC_011982	TCT	2	6	81444	81449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080177
1604	NC_011982	TGC	2	6	81473	81478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080177
1605	NC_011982	CG	3	6	81485	81490	0 %	0 %	50 %	50 %	222080177
1606	NC_011982	GCC	2	6	81597	81602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080177
1607	NC_011982	CGGT	2	8	81615	81622	0 %	25 %	50 %	25 %	222080177
1608	NC_011982	CAT	2	6	81705	81710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_011982	GTG	2	6	81737	81742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011982	CGAC	2	8	81766	81773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_011982	TCT	2	6	81850	81855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_011982	CGG	2	6	81862	81867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_011982	CGC	2	6	81868	81873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_011982	CAA	3	9	81882	81890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_011982	CCA	2	6	82009	82014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080178
1616	NC_011982	GTTC	2	8	82027	82034	0 %	50 %	25 %	25 %	222080178
1617	NC_011982	GC	3	6	82095	82100	0 %	0 %	50 %	50 %	222080178
1618	NC_011982	CCA	2	6	82123	82128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080178
1619	NC_011982	GCC	2	6	82179	82184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080178
1620	NC_011982	AGG	2	6	82201	82206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080178
1621	NC_011982	CGA	2	6	82232	82237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080178
1622	NC_011982	CCT	2	6	82240	82245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080178
1623	NC_011982	CGA	2	6	82280	82285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080178
1624	NC_011982	GCG	2	6	82344	82349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_011982	GCC	3	9	82412	82420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_011982	GCC	2	6	82493	82498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080179
1627	NC_011982	CGA	2	6	82546	82551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080179
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1629	NC_011982	AAC	2	6	82771	82776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_011982	CGAA	2	8	82968	82975	50 %	0 %	25 %	25 %	222080180
1631	NC_011982	CGC	2	6	83114	83119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_011982	CTT	2	6	83193	83198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080181
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1634	NC_011982	TTG	2	6	83439	83444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_011982	CTG	2	6	83624	83629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080182
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1637	NC_011982	GC	3	6	83655	83660	0 %	0 %	50 %	50 %	222080182
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1671	NC_011982	GC	3	6	85162	85167	0 %	0 %	50 %	50 %	222080184
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1878	NC_011982	ACATCG	2	12	95162	95173	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222080193
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